This work has described synthetic strategies towards well-defined structures resembling capsular polysaccharide (CPS) fragments, CPS mimics, teichoic acid (TA) fragments as well as a third-generation ring-closing tandem metathesis (RCM) linker to better exploit the potential of automated synthesis.

Promotor: G.A. van der Marel, Co-promotor: D.C. Codée

Schistosomiasis is an acute and chronic disease caused by blood dwelling parasitic trematodes of the genus Schistosoma, and it is classified as the second most socioeconomically devastating parasitic disease, second only to malaria.

An objective of this research was to achieve direct, well-defined and non-rate-limiting electron transfer between respiratory enzymes and the electrode surface by means of 'Q-wires'.

Het proefschrift omschrijft de chemische synthese van fenolische glycolipiden van verschillende mycobacteriën met het doel om deze te kunnen gebruiken voor immunologisch onderzoek.

Promotor: G. A. van der Marel, Co-promotor: D. V. Filippov

Chapter 2 describes a post-synthetic methodology to introduce a fluorescent label in highly lipophilic, Pam3Cys based conjugates.

De master Biology is een samenwerking tussen het Instituut Biologie Leiden, Naturalis en het Centrum voor Milieuwetenschappen Leiden waardoor het programma een brede en diverse scope heeft. De opleiding biedt zeven specialisaties, waarvan vier researchspecialisaties die nauw verbonden zijn met het onderzoek…

Quantitative biology means exploiting mathematical modelling and computer simulation as a tool to gain additional insights into the meaning of experimental data. Discover in this minor when and how to apply these tools, in a multidisciplinary setting.

Cyclic peptides are investigated as a platform to induce different orientations between various ligands.

Promotie

Het chemische biologie-onderzoek bij het Leids Instituut voor Chemisch Onderzoek (LIC) is gericht op het begrijpen van biologische processen op moleculair niveau, om zo onze kennis te vergroten over gezondheid en ziekte van de mens.

De afdeling richt zich op het verbeteren van het wetenschappelijk begrip in de relatie tussen mens en natuur. Hoe beïnvloedt menselijk handelen (via bijvoorbeeld klimaatverandering, landgebruiksverandering en de emissie van mogelijk toxische verbindingen) de natuur in het algemeen en de biodiversiteit…

This Thesis describes a strategy to synthesize 1,2-cis-oligosaccharides modulated by additives, such as dimethylformamide (DMF), triphenylphosphine oxide (Ph3P=O) and N-methyl(phenyl)formamide (MPF), using building blocks that carry solely benzyl type protecting groups and are therefore of uniform r…

The thesis focuses on synthesis strategies in oligosaccharide campaigns, and the influence of protecting groups.

The work in this thesis has been focused on two subjects. The first is the assembly of alginate oligosaccharides and the generation of building blocks for the enzymatic synthesis of alginate, and the second is the total synthesis of large fragments of the zwitterionic SP1 polysaccharide.

In deze opleiding identificeer je evolutionaire veranderingen over de tijd en bestudeer je de oorsprong en het behoud van biologische variatie in de Tree of Life.

Na afronding van deze opleiding beschik je over een eerstegraads onderwijsbevoegdheid en ben je goed voorbereid op een carrière als docent Biologie in het voortgezet onderwijs.

This Thesis describes the design, synthesis and evaluation as glycoprocessing enzyme inhibitors of focused libraries of iminosugars.

Promotores: H.S. Overkleeft, G.A. van der Marel, Co-Promotor: J.D.C. Codee

This thesis describes the design and synthesis of fragments of various cell wall carbohydrates of the Streptococcus species, including the branched Group B-specific antigen (GBC) of Group B Streptococcus, glycerol phosphate (GroP) modified group A carbohydrate (GAC), and the O-acetylated type 1 capsular…

Sphingolipids are important membrane compounds with a variety of functions. In mammalian cells, different enzymes are involved in the metabolism of sphingolipids, but interruption of this metabolism process leads to different diseases.

Glycoconjugate vaccines are composed of microbial poly- or oligosaccharides covalently linked to a carrier protein.

This thesis describes the synthesis and biological evaluation of TLR2/6, TLR4, TLR7/8 and TLR9 ligands, of which the activity can be conditionally controlled.

In 2018, the number of mobile phone users will reach about 4.9 billion. Assuming an average of 5 photos taken per day using the built-in cameras would result in about 9 trillion photos annually.

Antibiotic resistance, caused by widespread use of antibiotics, leads to bacterial infections that are difficult, if not impossible, to treat and is a major worldwide health concern.

Van systeembiologische modellering een centrale pijler van het onderzoek in de biologie maken.

Deze opleiding biedt de mogelijkheid om biologie-onderzoek te combineren met kennis over ondernemerschap en ervaring in het bedrijfsleven.

The work described in this Thesis is focused on the assembly of oligosaccharide fragments derived from a fungal polysaccharide, galactosaminogalactan (GAG) and fragments of the exopolysaccharide Pel, generated by Pseudomonas aeruginosa.

Promotor: G.A. van der Marel, Co-promotor: J.D.C. Codée

Promotores: H.S. Overkleeft, G.A. van der Marel, Co-Promotor: R.G. Boot

LUMC Technology Focus Area (TFA) Data Analytics is een samenwerkingsverband van verschillende onderzoeksgroepen in het LUMC die nieuwe kwantitatieve en computationele methodologie ontwikkelen voor biomedisch en klinisch onderzoek.

In deze opleiding ligt de focus op het informeren van het algemene publiek over belangrijke wetenschappelijke onderwerpen en hoe je deze communicatie wetenschappelijk onderbouwt.

Deze opleiding biedt de mogelijkheid om onderzoek op moleculair, cellulair en organismaal niveau te verenigen, maar biedt ook de mogelijkheid om je te specialiseren op één van deze niveaus.

This thesis describes the design, synthesis, and immunological evaluation of varying (neo)antigenic peptide conjugates containing either a TLR2 or a TLR7 agonist.

Hydrocarbonylation of alkenes with carboxylic acids in synthesis of carboxylic acid anhydrides is relatively less explored. We herein present a study and optimization of a palladium-catalyzed hydrocarbonylation reaction of alkenes using carboxylic acids as the nucleophile, by which acid anhydrides can…

Balsaminaceae is a diverse plant family characterized by a huge floral morphological diversity.

Carbohydrates are present on the surface of bacteria making them suitable antigen candidates for vaccine development. This thesis deals with the synthesis of two carbohydrate-based components; the capsular polisaccharide of S. aureus type 5 and teichoic acids from staphilococci and enterococci speci…

The main subject of this thesis is the design and synthesis of paramagnetic molecules for protein studies with NMR and EPR spectroscopy.

De afdeling Environmental Biology (CML-EB) houdt zich bezig met vraagstukken rondom biodiversiteit en natuurlijke hulpbronnen op het platteland in westerse en niet-westerse gebieden.

Hoe kunnen we met behulp van moleculair gereedschap meer inzicht krijgen in de ziekteverwekkende eigenschappen van de Neisseria pili?

We developed the bitterling as a unique, well-studied model organism in the area of the evolutionary ecology of brood parasitism. The bitterling-mussel relationship, interspecific mussel host preference, and mussel gill structure are studied in detail, to help understand the developmental adaptation…

Promotores: Prof.dr. H.S. Overkleeft, Prof.dr. G.A. van der Marel

In this thesis, we describe the potential of cell mechanical phenotyping for immune cell characterization, diagnosis, drug testing, as well as treatment of disease.